MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	TGG	2	6	1042	1047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707136
2	NC_006530	GGC	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56707136
3	NC_006530	CTT	2	6	1080	1085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707136
4	NC_006530	GGT	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707136
5	NC_006530	CG	3	6	1167	1172	0 %	0 %	50 %	50 %	56707136
6	NC_006530	GAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707136
7	NC_006530	GTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707136
8	NC_006530	CGG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56707136
9	NC_006530	AGTGCC	2	12	1436	1447	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56707136
10	NC_006530	GTT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707136
11	NC_006530	CT	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	56707136
12	NC_006530	AAT	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707136
13	NC_006530	GAAA	2	8	1983	1990	75 %	0 %	25 %	0 %	56707137
14	NC_006530	CGT	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707137
15	NC_006530	TAAC	2	8	2043	2050	50 %	25 %	0 %	25 %	56707137
16	NC_006530	TGAG	2	8	2065	2072	25 %	25 %	50 %	0 %	56707137
17	NC_006530	AGTA	2	8	2079	2086	50 %	25 %	25 %	0 %	56707137
18	NC_006530	AAG	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707137
19	NC_006530	CTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707137
20	NC_006530	CCG	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56707137
21	NC_006530	TAAA	2	8	3245	3252	75 %	25 %	0 %	0 %	56707139
22	NC_006530	TTA	2	6	3256	3261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
23	NC_006530	TAT	2	6	3275	3280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
24	NC_006530	AAC	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707139
25	NC_006530	AGTA	2	8	3426	3433	50 %	25 %	25 %	0 %	56707139
26	NC_006530	ATT	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
27	NC_006530	TGC	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707139
28	NC_006530	ATT	2	6	3551	3556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
29	NC_006530	ATG	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707139
30	NC_006530	GCA	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707139
31	NC_006530	ATAA	2	8	3673	3680	75 %	25 %	0 %	0 %	56707139
32	NC_006530	AAC	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707139
33	NC_006530	ACA	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707139
34	NC_006530	AAAT	2	8	3846	3853	75 %	25 %	0 %	0 %	56707139
35	NC_006530	TTA	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
36	NC_006530	CTG	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707139
37	NC_006530	TGG	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707139
38	NC_006530	TCA	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707139
39	NC_006530	TGG	2	6	4059	4064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707139
40	NC_006530	GAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707139
41	NC_006530	TAA	2	6	4077	4082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707139
42	NC_006530	ATT	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
43	NC_006530	TAA	2	6	4115	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707139
44	NC_006530	AT	3	6	4152	4157	50 %	50 %	0 %	0 %	56707140
45	NC_006530	TC	3	6	4180	4185	0 %	50 %	0 %	50 %	56707140
46	NC_006530	AATG	2	8	4239	4246	50 %	25 %	25 %	0 %	56707140
47	NC_006530	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	56707140
48	NC_006530	ATTA	2	8	4303	4310	50 %	50 %	0 %	0 %	56707140
49	NC_006530	CT	3	6	4311	4316	0 %	50 %	0 %	50 %	56707140
50	NC_006530	ATT	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707140
51	NC_006530	AAAT	2	8	4346	4353	75 %	25 %	0 %	0 %	56707140
52	NC_006530	AAG	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707140
53	NC_006530	AAG	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707140
54	NC_006530	AAG	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707140
55	NC_006530	ATT	2	6	4547	4552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707140
56	NC_006530	TAT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707140
57	NC_006530	TGA	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707140
58	NC_006530	AAAT	2	8	4572	4579	75 %	25 %	0 %	0 %	56707140
59	NC_006530	AAT	2	6	4609	4614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707140
60	NC_006530	TTA	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707142
61	NC_006530	ACT	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707142
62	NC_006530	ATG	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707142
63	NC_006530	AGC	3	9	5983	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707142
64	NC_006530	AAC	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707142
65	NC_006530	CTT	2	6	6020	6025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707142
66	NC_006530	AGA	2	6	6043	6048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707142
67	NC_006530	TGA	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707142
68	NC_006530	ATT	2	6	6132	6137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707142
69	NC_006530	ATT	2	6	6244	6249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707143
70	NC_006530	GAT	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707143
71	NC_006530	GCA	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707143
72	NC_006530	AAT	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707143
73	NC_006530	ATT	2	6	6474	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707143
74	NC_006530	AAG	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707143
75	NC_006530	TAA	2	6	6675	6680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707144
76	NC_006530	T	6	6	6718	6723	0 %	100 %	0 %	0 %	56707144
77	NC_006530	ATTT	2	8	6759	6766	25 %	75 %	0 %	0 %	56707144
78	NC_006530	T	6	6	6837	6842	0 %	100 %	0 %	0 %	56707144
79	NC_006530	A	6	6	6884	6889	100 %	0 %	0 %	0 %	56707145
80	NC_006530	TAT	2	6	6906	6911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707145
81	NC_006530	CAT	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707145
82	NC_006530	AAT	2	6	6934	6939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707145
83	NC_006530	GCC	2	6	6959	6964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56707145
84	NC_006530	TCAG	2	8	7004	7011	25 %	25 %	25 %	25 %	56707145
85	NC_006530	TCT	2	6	7026	7031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707145
86	NC_006530	GCC	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56707145
87	NC_006530	GTT	2	6	7142	7147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707145
88	NC_006530	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707146
89	NC_006530	TGC	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707146
90	NC_006530	AGG	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56707146
91	NC_006530	ACA	2	6	7333	7338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707146
92	NC_006530	TGAT	2	8	7391	7398	25 %	50 %	25 %	0 %	56707146
93	NC_006530	ACC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56707146
94	NC_006530	ATT	2	6	7495	7500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707146
95	NC_006530	GTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707146
96	NC_006530	GAA	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707146
97	NC_006530	AC	3	6	7657	7662	50 %	0 %	0 %	50 %	56707146
98	NC_006530	GTC	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707146
99	NC_006530	ACA	2	6	7865	7870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707146
100	NC_006530	AAC	2	6	7956	7961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707146
101	NC_006530	GAA	3	9	7990	7998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707146
102	NC_006530	AAT	2	6	7999	8004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707146
103	NC_006530	T	6	6	8026	8031	0 %	100 %	0 %	0 %	56707146
104	NC_006530	A	6	6	8335	8340	100 %	0 %	0 %	0 %	56707147
105	NC_006530	TAT	2	6	9161	9166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707148
106	NC_006530	CAA	2	6	9175	9180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
107	NC_006530	CAA	2	6	9332	9337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
108	NC_006530	TGA	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
109	NC_006530	TTTTAC	2	12	9365	9376	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56707148
110	NC_006530	ATTT	2	8	9394	9401	25 %	75 %	0 %	0 %	56707148
111	NC_006530	AGT	2	6	9419	9424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
112	NC_006530	A	7	7	9431	9437	100 %	0 %	0 %	0 %	56707148
113	NC_006530	AAC	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
114	NC_006530	CAAAAA	2	12	9487	9498	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	56707148
115	NC_006530	TGA	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
116	NC_006530	CA	4	8	9740	9747	50 %	0 %	0 %	50 %	56707148
117	NC_006530	TA	3	6	9751	9756	50 %	50 %	0 %	0 %	56707148
118	NC_006530	ATA	2	6	9769	9774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707148
119	NC_006530	TGA	2	6	9881	9886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
120	NC_006530	TCT	2	6	9919	9924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707148
121	NC_006530	ACT	2	6	9944	9949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707148
122	NC_006530	CAA	2	6	9972	9977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
123	NC_006530	GCG	2	6	9980	9985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56707148
124	NC_006530	A	8	8	10076	10083	100 %	0 %	0 %	0 %	56707148
125	NC_006530	TGA	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
126	NC_006530	AAG	2	6	10121	10126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707148
127	NC_006530	CGA	2	6	10127	10132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707148
128	NC_006530	TGG	2	6	10194	10199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707148
129	NC_006530	CAA	2	6	10203	10208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
130	NC_006530	GAA	2	6	10240	10245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707148
131	NC_006530	AGCG	2	8	10258	10265	25 %	0 %	50 %	25 %	56707148
132	NC_006530	TTG	2	6	10468	10473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707149
133	NC_006530	AGCA	2	8	10511	10518	50 %	0 %	25 %	25 %	56707149
134	NC_006530	AAGA	2	8	10589	10596	75 %	0 %	25 %	0 %	56707149
135	NC_006530	AT	3	6	10694	10699	50 %	50 %	0 %	0 %	56707150
136	NC_006530	GTGG	2	8	10888	10895	0 %	25 %	75 %	0 %	56707150
137	NC_006530	AT	3	6	10898	10903	50 %	50 %	0 %	0 %	56707150
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150	NC_006530	CAA	2	6	11406	11411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707150
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159	NC_006530	T	6	6	11999	12004	0 %	100 %	0 %	0 %	56707152
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171	NC_006530	A	6	6	12882	12887	100 %	0 %	0 %	0 %	56707153
172	NC_006530	A	6	6	12901	12906	100 %	0 %	0 %	0 %	56707153
173	NC_006530	A	7	7	12939	12945	100 %	0 %	0 %	0 %	56707153
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268	NC_006530	ATG	2	6	18703	18708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707159
269	NC_006530	GCA	2	6	18759	18764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707159
270	NC_006530	GCA	2	6	18774	18779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707159
271	NC_006530	GATT	2	8	18893	18900	25 %	50 %	25 %	0 %	56707159
272	NC_006530	ATC	2	6	18940	18945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707159
273	NC_006530	TGC	2	6	19001	19006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707160
274	NC_006530	TAA	2	6	19010	19015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707160
275	NC_006530	ATT	2	6	19029	19034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707160
276	NC_006530	T	7	7	19057	19063	0 %	100 %	0 %	0 %	56707160
277	NC_006530	TATT	2	8	19094	19101	25 %	75 %	0 %	0 %	56707160
278	NC_006530	T	7	7	19103	19109	0 %	100 %	0 %	0 %	56707160
279	NC_006530	GCA	2	6	19143	19148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707160
280	NC_006530	CCAG	2	8	19150	19157	25 %	0 %	25 %	50 %	56707160
281	NC_006530	TAC	2	6	19206	19211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707160
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283	NC_006530	GCA	2	6	19321	19326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707160
284	NC_006530	ATT	2	6	19330	19335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707160
285	NC_006530	T	7	7	19358	19364	0 %	100 %	0 %	0 %	56707160
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289	NC_006530	CAT	2	6	19451	19456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707160
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293	NC_006530	AATT	2	8	19728	19735	50 %	50 %	0 %	0 %	56707160
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297	NC_006530	AAAT	2	8	19860	19867	75 %	25 %	0 %	0 %	56707160
298	NC_006530	A	6	6	19882	19887	100 %	0 %	0 %	0 %	56707161
299	NC_006530	GAA	2	6	19902	19907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707161
300	NC_006530	TAA	2	6	19940	19945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707161
301	NC_006530	GAT	2	6	20043	20048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707161
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303	NC_006530	ATT	2	6	20197	20202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707161
304	NC_006530	GAA	2	6	20298	20303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707161
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307	NC_006530	T	6	6	20397	20402	0 %	100 %	0 %	0 %	56707162
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312	NC_006530	T	6	6	20656	20661	0 %	100 %	0 %	0 %	56707162
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398	NC_006530	AAC	2	6	30244	30249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707171
399	NC_006530	TTC	2	6	30329	30334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707171
400	NC_006530	TTA	2	6	30598	30603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707172
401	NC_006530	TTG	2	6	30703	30708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707172
402	NC_006530	AAG	2	6	30769	30774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707172
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405	NC_006530	AAG	2	6	30892	30897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707172
406	NC_006530	TGA	2	6	30934	30939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707172
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411	NC_006530	GAT	2	6	31091	31096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707172
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429	NC_006530	TTGA	2	8	33520	33527	25 %	50 %	25 %	0 %	56707174
430	NC_006530	GAC	2	6	33535	33540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707174
431	NC_006530	GAC	2	6	33576	33581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707174
432	NC_006530	CTT	2	6	33582	33587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707174
433	NC_006530	GAA	2	6	33600	33605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707174
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436	NC_006530	ACTT	2	8	33742	33749	25 %	50 %	0 %	25 %	56707174
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438	NC_006530	TACG	2	8	33771	33778	25 %	25 %	25 %	25 %	56707174
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